Petr Fafek byl účastníkem prvního československého odboje. Do toho druhého se zapojil okamžitě po příchodu nacistů do protektorátu. V roce 1940 byl poprvé vyšetřován gestapem, ale po krátkém vyšetřování byl propuštěn a v odboji pokračoval. V roce 1942 se Petr Fafek s celou rodinou zapojil do podpory výsadku Anthropoid.
